RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.56□□□□□ -0.24
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APOBEC3C-201ENST00000361441 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.55□□□□□ -0.24
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APOBEC3C-201ENST00000361441 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.55□□□□□ -0.24
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APOBEC3C-201ENST00000361441 NUP160Q12769 1436 aa13.41□□□□□ -0.26
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APOBEC3C-201ENST00000361441 CAPN2P17655 700 aa13.41□□□□□ -0.26
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APOBEC3C-201ENST00000361441 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.4□□□□□ -0.26
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APOBEC3C-201ENST00000361441 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.4□□□□□ -0.26
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.4□□□□□ -0.26
APOBEC3C-201ENST00000361441 COG6Q9Y2V7 657 aa13.4□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.39□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.39□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLFN5Q08AF3 891 aa13.39□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 AFAP1Q8N556 730 aa13.39□□□□□ -0.27
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