RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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SH3BP4-201ENST00000344528 MARCH6O60337 910 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKAR2BP31323 418 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF20Q5VTR2 975 aa19.99■□□□□ 0.79
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SH3BP4-201ENST00000344528 VPS37DQ86XT2 251 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK19Q9BWU1 502 aa19.99■□□□□ 0.79
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SH3BP4-201ENST00000344528 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.98■□□□□ 0.79
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SH3BP4-201ENST00000344528 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
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SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.94■□□□□ 0.78
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SH3BP4-201ENST00000344528 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 USP35Q9P2H5 1018 aa19.94■□□□□ 0.78
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SH3BP4-201ENST00000344528 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM29Q14134 588 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 NAIPQ13075 1403 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 CD109Q6YHK3 1445 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF11O15085 1522 aa19.89■□□□□ 0.77
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SH3BP4-201ENST00000344528 MCTP1Q6DN14 999 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIN2AQ12879 1464 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 NEUROD6Q96NK8 337 aa19.88■□□□□ 0.77
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SH3BP4-201ENST00000344528 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC4A3P48751 1232 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE3AQ14432 1141 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 WWC1Q8IX03 1113 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 ERICH2A1L162 156 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC45O75419 566 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 STRN4Q9NRL3 753 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR63Q8IWG1 891 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 BECN2A8MW95 431 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 SURF6O75683 361 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-201ENST00000344528 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
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SH3BP4-201ENST00000344528 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 TPM3P06753 285 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 NFXL1Q6ZNB6 911 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 WASHC4Q2M389 1173 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 SPG7Q9UQ90 795 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD21O60216 631 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXW7Q969H0 707 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 SMC3Q9UQE7 1217 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRL1O94910 1474 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTROBQ8N137 903 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 NUCB2P80303 420 aa19.8■□□□□ 0.76
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