RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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PKHD1-201ENST00000340994 PKD2Q13563 968 aa9.83□□□□□ -0.84
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PKHD1-201ENST00000340994 XBP1P17861 261 aa9.83□□□□□ -0.84
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PKHD1-201ENST00000340994 DYNC1I1O14576 645 aa9.82□□□□□ -0.84
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PKHD1-201ENST00000340994 CRACR2AQ9BSW2 395 aa9.77□□□□□ -0.84
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PKHD1-201ENST00000340994 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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PKHD1-201ENST00000340994 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.76□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.76□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 ZSCAN12O43309 604 aa9.76□□□□□ -0.85
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PKHD1-201ENST00000340994 ERICH4A6NGS2 130 aa9.75□□□□□ -0.85
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PKHD1-201ENST00000340994 CNTROBQ8N137 903 aa9.75□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 RNF214Q8ND24 703 aa9.75□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 COG6Q9Y2V7 657 aa9.75□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.74□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 KRT85P78386 507 aa9.74□□□□□ -0.85
PKHD1-201ENST00000340994 CFAP45Q9UL16 551 aa9.74□□□□□ -0.85
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