RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326407.10

ITM2C-201, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-201ENST00000326407 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.25■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.25■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.25■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 MED14O60244 1454 aa22.24■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.24■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 PIK3C2GO75747 1445 aa22.22■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 PDE3BQ13370 1112 aa22.22■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 STRCQ7RTU9 1775 aa22.21■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 CERKQ8TCT0 537 aa22.2■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.2■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.16■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 SLC24A1O60721 1099 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ITM2C-201ENST00000326407 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 TBX22Q9Y458 520 aa22.13■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 ALKQ9UM73 1620 aa22.13■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.13■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.13■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 DIP2AQ14689 1571 aa22.11■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 MSH5O43196 834 aa22.11■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.1■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ITM2C-201ENST00000326407 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 PPP2R1AP30153 589 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 METP08581 1390 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 ADGRB1O14514 1584 aa22.07■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.06■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 PIK3R4Q99570 1358 aa22.06■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.06■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.05■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.05■■□□□ 1.12
ITM2C-201ENST00000326407 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.01■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 EXOC6Q8TAG9 804 aa22■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 PTPRUQ92729 1446 aa22■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 KCNA6P17658 529 aa21.98■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.98■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 ABCC11Q96J66 1382 aa21.97■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 STK26Q9P289 416 aa21.96■■□□□ 1.11
ITM2C-201ENST00000326407 TECPR2O15040 1411 aa21.95■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 NWD1Q149M9 1564 aa21.95■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.94■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.94■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 SIRT1Q96EB6 747 aa21.92■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.92■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.91■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 DLC1Q96QB1 1528 aa21.91■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 PTCH1Q13635 1447 aa21.91■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 ZNF521Q96K83 1311 aa21.91■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.9■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 USP32Q8NFA0 1604 aa21.9■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 CPS1P31327 1500 aa21.9■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.9■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ITM2C-201ENST00000326407 EVC2Q86UK5 1308 aa21.89■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.88■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.88■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.87■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.87■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 PLIN1O60240 522 aa21.86■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.86■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 GOLGA2Q08379 1002 aa21.86■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 PRAM1Q96QH2 718 aa21.86■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 SHPRHQ149N8 1683 aa21.85■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.85■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.85■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 CRBNQ96SW2 442 aa21.83■■□□□ 1.09
ITM2C-201ENST00000326407 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 POGKQ9P215 609 aa21.83■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.81■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 SLFN5Q08AF3 891 aa21.8■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 MORC1Q86VD1 984 aa21.8■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.8■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 TMEM94Q12767 1356 aa21.8■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.79■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 NGEFQ8N5V2 710 aa21.78■■□□□ 1.08
ITM2C-201ENST00000326407 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms