RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.78■■□□□ 1.24
SSR4-201ENST00000320857 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.77■■□□□ 1.24
SSR4-201ENST00000320857 DLC1Q96QB1 1528 aa22.76■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 NUDCQ9Y266 331 aa22.75■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.74■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 POGKQ9P215 609 aa22.74■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 PRAM1Q96QH2 718 aa22.73■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.73■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.73■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 HSPA2P54652 639 aa22.72■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 ABCC11Q96J66 1382 aa22.72■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
SSR4-201ENST00000320857 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.7■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 BCANQ96GW7 911 aa22.7■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 SLIT1O75093 1534 aa22.69■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.69■■□□□ 1.22
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SSR4-201ENST00000320857 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.69■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.69■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.69■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.69■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 PDE3BQ13370 1112 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 CABP2Q9NPB3 220 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 METP08581 1390 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.67■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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SSR4-201ENST00000320857 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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SSR4-201ENST00000320857 SIRT1Q96EB6 747 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 TECPR2O15040 1411 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 MORC1Q86VD1 984 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 NSD2O96028 1365 aa22.64■■□□□ 1.22
SSR4-201ENST00000320857 EID1Q9Y6B2 187 aa22.64■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.62■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.62■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 MED14O60244 1454 aa22.61■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 CPS1P31327 1500 aa22.61■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.61■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.6■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.6■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 CDK19Q9BWU1 502 aa22.59■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SSR4-201ENST00000320857 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
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SSR4-201ENST00000320857 A0A1W2PP64 1363 aa22.57■■□□□ 1.2
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SSR4-201ENST00000320857 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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SSR4-201ENST00000320857 TBX22Q9Y458 520 aa22.54■■□□□ 1.2
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SSR4-201ENST00000320857 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.51■■□□□ 1.19
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SSR4-201ENST00000320857 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.5■■□□□ 1.19
SSR4-201ENST00000320857 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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SSR4-201ENST00000320857 NGEFQ8N5V2 710 aa22.49■■□□□ 1.19
SSR4-201ENST00000320857 CABP1Q9NZU7 370 aa22.48■■□□□ 1.19
SSR4-201ENST00000320857 ATP7BP35670 1465 aa22.48■■□□□ 1.19
SSR4-201ENST00000320857 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.47■■□□□ 1.19
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SSR4-201ENST00000320857 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.46■■□□□ 1.19
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SSR4-201ENST00000320857 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SSR4-201ENST00000320857 ZNF521Q96K83 1311 aa22.44■■□□□ 1.18
SSR4-201ENST00000320857 PTCH1Q13635 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
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SSR4-201ENST00000320857 PIK3R4Q99570 1358 aa22.42■■□□□ 1.18
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SSR4-201ENST00000320857 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.4■■□□□ 1.18
SSR4-201ENST00000320857 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SSR4-201ENST00000320857 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.39■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 RUNDC1Q96C34 613 aa22.37■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.37■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.36■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 SLFN5Q08AF3 891 aa22.34■■□□□ 1.17
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