RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 EVC2Q86UK5 1308 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC11Q96J66 1382 aa22.21■■□□□ 1.15
CHTF18-202ENST00000317063 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 MYOM1P52179 1685 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 CCER2I3L3R5 266 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 PTPRUQ92729 1446 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 CDK19Q9BWU1 502 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 TBX22Q9Y458 520 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 HSPA2P54652 639 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 MED14O60244 1454 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.15■■□□□ 1.14
CHTF18-202ENST00000317063 NUTM2FA1L443 756 aa22.14■■□□□ 1.13
CHTF18-202ENST00000317063 MRS2Q9HD23 443 aa22.14■■□□□ 1.13
CHTF18-202ENST00000317063 DLC1Q96QB1 1528 aa22.11■■□□□ 1.13
CHTF18-202ENST00000317063 KCNA6P17658 529 aa22.11■■□□□ 1.13
CHTF18-202ENST00000317063 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.1■■□□□ 1.13
CHTF18-202ENST00000317063 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CHTF18-202ENST00000317063 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-202ENST00000317063 CABP1Q9NZU7 370 aa22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-202ENST00000317063 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 TECPR2O15040 1411 aa22.08■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHG5O94827 1062 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 CPS1P31327 1500 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 RALBP1Q15311 655 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 SIRT1Q96EB6 747 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-202ENST00000317063 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1W2PP64 1363 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-202ENST00000317063 ATAD2Q6PL18 1390 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-202ENST00000317063 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-202ENST00000317063 DIP2AQ14689 1571 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-202ENST00000317063 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-202ENST00000317063 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-202ENST00000317063 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 PPP2R1AP30153 589 aa21.95■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.95■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 NLRP13Q86W25 1043 aa21.95■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.95■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.94■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.94■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 PTCH1Q13635 1447 aa21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 PIK3R4Q99570 1358 aa21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 MORC1Q86VD1 984 aa21.92■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.92■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.91■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.91■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 C14orf37Q86TY3 774 aa21.9■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
CHTF18-202ENST00000317063 FYB1O15117 783 aa21.89■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 ATP7BP35670 1465 aa21.89■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.88■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.88■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 FBLN1P23142 703 aa21.87■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.87■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 ACEP12821 1306 aa21.85■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRB2O60241 1585 aa21.84■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 NME9Q86XW9 330 aa21.83■■□□□ 1.09
CHTF18-202ENST00000317063 USP32Q8NFA0 1604 aa21.83■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.82■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 STRCQ7RTU9 1775 aa21.82■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.82■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 MSH5O43196 834 aa21.81■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.8■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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