RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 METP08581 1390 aa23■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 LTKP29376 864 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 CPS1P31327 1500 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 CABP2Q9NPB3 220 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 USP32Q8NFA0 1604 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 TECPR2O15040 1411 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 SIRT1Q96EB6 747 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 MED14O60244 1454 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 DIP2AQ14689 1571 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 PPP2R1AP30153 589 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 CDK19Q9BWU1 502 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC5-201ENST00000312492 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXC5-201ENST00000312492 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXC5-201ENST00000312492 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXC5-201ENST00000312492 A0A1W2PP64 1363 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXC5-201ENST00000312492 TBX22Q9Y458 520 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXC5-201ENST00000312492 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC5-201ENST00000312492 NSD2O96028 1365 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC5-201ENST00000312492 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC5-201ENST00000312492 ADGRB2O60241 1585 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 INSRP06213 1382 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 PTPRUQ92729 1446 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 MORC1Q86VD1 984 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 ATP7BP35670 1465 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 PTCH1Q13635 1447 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 CABP1Q9NZU7 370 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXC5-201ENST00000312492 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 PIK3R4Q99570 1358 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 ITSN1Q15811 1721 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXC5-201ENST00000312492 AKAP12Q02952 1782 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 FYB1O15117 783 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 SHPRHQ149N8 1683 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 NEFLP07196 543 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC5-201ENST00000312492 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 KCNA6P17658 529 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 CFAP53Q96M91 514 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 MTHFSP49914 203 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 NUDCQ9Y266 331 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 PDE3BQ13370 1112 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXC5-201ENST00000312492 FKBP8Q14318 412 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 NUTM2FA1L443 756 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 ACEP12821 1306 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXC5-201ENST00000312492 NWD1Q149M9 1564 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms