RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC11Q96J66 1382 aa28.85■■■□□ 2.21
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.83■■■□□ 2.21
SNRNP25-201ENST00000293861 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.82■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 NUDCQ9Y266 331 aa28.82■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.81■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.81■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.8■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 CABP2Q9NPB3 220 aa28.79■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 SLIT1O75093 1534 aa28.77■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 METP08581 1390 aa28.77■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.77■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 TECPR2O15040 1411 aa28.77■■■□□ 2.2
SNRNP25-201ENST00000293861 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.76■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.76■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 SIRT1Q96EB6 747 aa28.75■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE3BQ13370 1112 aa28.74■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.74■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 NSD2O96028 1365 aa28.73■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 CPS1P31327 1500 aa28.73■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.72■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.72■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.71■■■□□ 2.19
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 EID1Q9Y6B2 187 aa28.7■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 LTKP29376 864 aa28.69■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.69■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 BCANQ96GW7 911 aa28.69■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 CDK19Q9BWU1 502 aa28.69■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.68■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.68■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.67■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 MED14O60244 1454 aa28.67■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.67■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1W2PP64 1363 aa28.66■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 MORC1Q86VD1 984 aa28.65■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.65■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.64■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.64■■■□□ 2.18
SNRNP25-201ENST00000293861 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.63■■■□□ 2.17
SNRNP25-201ENST00000293861 SHPRHQ149N8 1683 aa28.62■■■□□ 2.17
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SNRNP25-201ENST00000293861 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.61■■■□□ 2.17
SNRNP25-201ENST00000293861 DIP2AQ14689 1571 aa28.61■■■□□ 2.17
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP7BP35670 1465 aa28.59■■■□□ 2.17
SNRNP25-201ENST00000293861 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SNRNP25-201ENST00000293861 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.57■■■□□ 2.16
SNRNP25-201ENST00000293861 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SNRNP25-201ENST00000293861 TBX22Q9Y458 520 aa28.56■■■□□ 2.16
SNRNP25-201ENST00000293861 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRB2O60241 1585 aa28.55■■■□□ 2.16
SNRNP25-201ENST00000293861 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.55■■■□□ 2.16
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SNRNP25-201ENST00000293861 CABP1Q9NZU7 370 aa28.54■■■□□ 2.16
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF521Q96K83 1311 aa28.51■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.51■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRUQ92729 1446 aa28.5■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 NGEFQ8N5V2 710 aa28.5■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.5■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 PTCH1Q13635 1447 aa28.48■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.48■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.48■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 MTHFSP49914 203 aa28.46■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 FYB1O15117 783 aa28.45■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CFAP53Q96M91 514 aa28.45■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.45■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.45■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 AKAP12Q02952 1782 aa28.44■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.44■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 PIK3R4Q99570 1358 aa28.44■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.43■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.43■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.42■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 ITSN1Q15811 1721 aa28.42■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.41■■■□□ 2.14
SNRNP25-201ENST00000293861 APAF1O14727 1248 aa28.39■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA2Q08379 1002 aa28.38■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.38■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.37■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.36■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.36■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.35■■■□□ 2.13
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
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