RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.78■■□□□ 1.08
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COL5A3-201ENST00000264828 VPS37DQ86XT2 251 aa21.78■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 PDILTQ8N807 584 aa21.77■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 AK7Q96M32 723 aa21.76■■□□□ 1.07
COL5A3-201ENST00000264828 ROCK1Q13464 1354 aa21.76■■□□□ 1.07
COL5A3-201ENST00000264828 ERICH2A1L162 156 aa21.76■■□□□ 1.07
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COL5A3-201ENST00000264828 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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COL5A3-201ENST00000264828 RUNDC1Q96C34 613 aa21.74■■□□□ 1.07
COL5A3-201ENST00000264828 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.74■■□□□ 1.07
COL5A3-201ENST00000264828 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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COL5A3-201ENST00000264828 GRIN2BQ13224 1484 aa21.72■■□□□ 1.07
COL5A3-201ENST00000264828 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
COL5A3-201ENST00000264828 NCOA2Q15596 1464 aa21.71■■□□□ 1.07
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COL5A3-201ENST00000264828 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.69■■□□□ 1.06
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COL5A3-201ENST00000264828 WASHC4Q2M389 1173 aa21.69■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.69■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 CAGE1Q8TC20 777 aa21.69■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.69■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 ERC2O15083 957 aa21.69■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
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COL5A3-201ENST00000264828 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 MTMR7Q9Y216 660 aa21.68■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.68■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 SYNJ1O43426 1573 aa21.67■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 TRAK2O60296 914 aa21.67■■□□□ 1.06
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COL5A3-201ENST00000264828 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.66■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 PSME1Q06323 249 aa21.66■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 CDR1P51861 262 aa21.66■■□□□ 1.06
COL5A3-201ENST00000264828 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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COL5A3-201ENST00000264828 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.64■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 SDF4Q9BRK5 362 aa21.64■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 EPS15P42566 896 aa21.64■■□□□ 1.05
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COL5A3-201ENST00000264828 NESP48681 1621 aa21.63■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.62■■□□□ 1.05
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COL5A3-201ENST00000264828 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.62■■□□□ 1.05
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COL5A3-201ENST00000264828 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.62■■□□□ 1.05
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COL5A3-201ENST00000264828 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.62■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.61■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 TSPY26PQ9H489 355 aa21.61■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.61■■□□□ 1.05
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COL5A3-201ENST00000264828 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
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COL5A3-201ENST00000264828 SPC24Q8NBT2 197 aa21.6■■□□□ 1.05
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COL5A3-201ENST00000264828 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.6■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.6■■□□□ 1.05
COL5A3-201ENST00000264828 CNTROBQ8N137 903 aa21.59■■□□□ 1.05
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COL5A3-201ENST00000264828 ATP2B1P20020 1258 aa21.58■■□□□ 1.04
COL5A3-201ENST00000264828 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.58■■□□□ 1.04
COL5A3-201ENST00000264828 PSMA5P28066 241 aa21.57■■□□□ 1.04
COL5A3-201ENST00000264828 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
COL5A3-201ENST00000264828 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.57■■□□□ 1.04
COL5A3-201ENST00000264828 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
COL5A3-201ENST00000264828 IFT140Q96RY7 1462 aa21.57■■□□□ 1.04
COL5A3-201ENST00000264828 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.57■■□□□ 1.04
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