RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262033.10

PTGES3-201, Transcript of prostaglandin E synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGES3, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES3-201ENST00000262033 SLIT1O75093 1534 aa22.86■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.85■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.85■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 SIRT1Q96EB6 747 aa22.84■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 BCANQ96GW7 911 aa22.84■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.83■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 CABP2Q9NPB3 220 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 TECPR2O15040 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 MED14O60244 1454 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.77■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.77■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.77■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 CDK19Q9BWU1 502 aa22.77■■□□□ 1.24
PTGES3-201ENST00000262033 TBX22Q9Y458 520 aa22.76■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.75■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 PPP2R1AP30153 589 aa22.75■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.73■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.72■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 CPS1P31327 1500 aa22.72■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.71■■□□□ 1.23
PTGES3-201ENST00000262033 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.69■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.69■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.68■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 USP32Q8NFA0 1604 aa22.67■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 PTPRUQ92729 1446 aa22.67■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 DIP2AQ14689 1571 aa22.66■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 A0A1W2PP64 1363 aa22.66■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.65■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 CABP1Q9NZU7 370 aa22.65■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 INSRP06213 1382 aa22.65■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.65■■□□□ 1.22
PTGES3-201ENST00000262033 MORC1Q86VD1 984 aa22.64■■□□□ 1.21
PTGES3-201ENST00000262033 NSD2O96028 1365 aa22.64■■□□□ 1.21
PTGES3-201ENST00000262033 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.64■■□□□ 1.21
PTGES3-201ENST00000262033 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTGES3-201ENST00000262033 PIK3R4Q99570 1358 aa22.61■■□□□ 1.21
PTGES3-201ENST00000262033 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTGES3-201ENST00000262033 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTGES3-201ENST00000262033 PTCH1Q13635 1447 aa22.58■■□□□ 1.21
PTGES3-201ENST00000262033 ATP7BP35670 1465 aa22.57■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.57■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.57■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 ADGRB2O60241 1585 aa22.56■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 FYB1O15117 783 aa22.55■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.54■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.52■■□□□ 1.2
PTGES3-201ENST00000262033 KCNA6P17658 529 aa22.51■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.51■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.49■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 MTHFSP49914 203 aa22.49■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.47■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.47■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 NEFLP07196 543 aa22.47■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.47■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 FKBP8Q14318 412 aa22.46■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
PTGES3-201ENST00000262033 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.44■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 CFAP53Q96M91 514 aa22.44■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 PDE3BQ13370 1112 aa22.43■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 NUDCQ9Y266 331 aa22.42■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 NUTM2FA1L443 756 aa22.41■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.41■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 ACEP12821 1306 aa22.4■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.4■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 AKAP12Q02952 1782 aa22.39■■□□□ 1.18
PTGES3-201ENST00000262033 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.39■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 NME9Q86XW9 330 aa22.37■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 ITSN1Q15811 1721 aa22.36■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 SHPRHQ149N8 1683 aa22.36■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.36■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.35■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.34■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 NGEFQ8N5V2 710 aa22.33■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 COG3Q96JB2 828 aa22.33■■□□□ 1.17
PTGES3-201ENST00000262033 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms