RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 CABP1Q9NZU7 370 aa16.89■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 ROCK1Q13464 1354 aa16.89■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 CD109Q6YHK3 1445 aa16.89■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.88■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 FAM184AQ8NB25 1140 aa16.88■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 TPM4P67936 248 aa16.88■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.88■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 CREBRFQ8IUR6 639 aa16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 TRDNQ13061 729 aa16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 H3BQV1 296 aa16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 IFFO2Q5TF58 517 aa16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.86■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.86■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.86■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 ARAP1Q96P48 1450 aa16.85■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 PRKAR2BP31323 418 aa16.85■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.85■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.85■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.85■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.84■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 SYNJ1O43426 1573 aa16.84■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 CABP4P57796 275 aa16.84■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
USP22-201ENST00000261497 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.83■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 CCDC7Q96M83 1385 aa16.83■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 CCDC27Q2M243 656 aa16.83■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 CPLX1O14810 134 aa16.83■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 SPG7Q9UQ90 795 aa16.83■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.82■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.82■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.82■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 CRBNQ96SW2 442 aa16.81■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 REC8O95072 547 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 TRIM29Q14134 588 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 WASHC4Q2M389 1173 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 FYB1O15117 783 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 ERICH2A1L162 156 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 ERC2O15083 957 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 SLC4A3P48751 1232 aa16.8■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 ERBINQ96RT1 1412 aa16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 PHF14O94880 888 aa16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 RNF20Q5VTR2 975 aa16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 MCTP1Q6DN14 999 aa16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.79■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.78■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.78■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.77■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 PDE4AP27815 886 aa16.77■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.77■□□□□ 0.28
USP22-201ENST00000261497 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.77■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 PRXQ9BXM0 1461 aa16.77■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 PDE4CQ08493 712 aa16.77■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 CEP89Q96ST8 783 aa16.77■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa16.76■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 PRM3Q9NNZ6 103 aa16.76■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.76■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 HECW1Q76N89 1606 aa16.75■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 ADAMTS2O95450 1211 aa16.75■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 GNAI3P08754 354 aa16.75■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.75■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.75■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 TOP2BQ02880 1626 aa16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.74■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 PPP2R1AP30153 589 aa16.73■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.73■□□□□ 0.27
USP22-201ENST00000261497 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms