RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 STK26Q9P289 416 aa25.17■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.17■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 GLI2P10070 1586 aa25.16■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.16■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 PIK3C2BO00750 1634 aa25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 MTHFSP49914 203 aa25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 WWC1Q8IX03 1113 aa25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 E9PSI1 815 aa25.14■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.12■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 MS4A1P11836 297 aa25.12■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 RICTORQ6R327 1708 aa25.12■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 EVC2Q86UK5 1308 aa25.11■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 NBR1Q14596 966 aa25.11■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.1■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 SHPRHQ149N8 1683 aa25.1■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.08■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.08■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 RUNDC1Q96C34 613 aa25.06■■□□□ 1.6
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.06■■□□□ 1.6
LPCAT3-201ENST00000261407 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.05■■□□□ 1.6
LPCAT3-201ENST00000261407 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.04■■□□□ 1.6
LPCAT3-201ENST00000261407 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
LPCAT3-201ENST00000261407 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A1W2PP64 1363 aa25.01■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 PRAM1Q96QH2 718 aa25.01■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.01■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM69CQ0P6D2 419 aa25■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 NGEFQ8N5V2 710 aa25■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 PANK1Q8TE04 598 aa25■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 USP32Q8NFA0 1604 aa24.98■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.98■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.98■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 RGS3P49796 1198 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 CFAP53Q96M91 514 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHDP01880 384 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 COG6Q9Y2V7 657 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 ZFYVE9O95405 1425 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.96■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 TNNQ9UQP3 1299 aa24.96■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 POGKQ9P215 609 aa24.95■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 PTPRMP28827 1452 aa24.95■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.92■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 ABCC11Q96J66 1382 aa24.91■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 FYB1O15117 783 aa24.91■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 C8orf34Q49A92 452 aa24.91■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 NSD2O96028 1365 aa24.9■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 PDE3AQ14432 1141 aa24.9■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 WDR63Q8IWG1 891 aa24.9■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 MLECQ14165 292 aa24.89■■□□□ 1.58
LPCAT3-201ENST00000261407 RLBP1P12271 317 aa24.89■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.88■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 CDK19Q9BWU1 502 aa24.88■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 TSPOAP1O95153 1857 aa24.87■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 CABP1Q9NZU7 370 aa24.87■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 FBLN1P23142 703 aa24.87■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC27Q2M243 656 aa24.87■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.87■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.87■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM161AQ3B820 660 aa24.86■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 ALKQ9UM73 1620 aa24.85■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.84■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.84■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC4A3P48751 1232 aa24.83■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.83■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.81■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 NLRP1Q9C000 1473 aa24.81■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 DIP2BQ9P265 1576 aa24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.78■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 ADGRB2O60241 1585 aa24.77■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms