RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259750.8

TTBK1-201, Transcript of tau tubulin kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTBK1, Length 6,932 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK1-201ENST00000259750 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.23■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.23■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 RUFY1Q96T51 708 aa19.22■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 EPS15P42566 896 aa19.22■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa19.21■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 NUTM2GQ5VZR2 741 aa19.21■□□□□ 0.67
TTBK1-201ENST00000259750 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 TEX35Q5T0J7 233 aa19.2■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 SMARCA4P51532 1647 aa19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 PIP4K2BP78356 416 aa19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 ERC2O15083 957 aa19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 HMOX1P09601 288 aa19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 AK7Q96M32 723 aa19.19■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 BRMS1Q9HCU9 246 aa19.18■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa19.18■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.18■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC7Q96M83 1385 aa19.18■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.18■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 TMEM132AQ24JP5 1023 aa19.17■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 PDILTQ8N807 584 aa19.16■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 IFT57Q9NWB7 429 aa19.16■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 FAM177BA6PVY3 158 aa19.16■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 OLFM4Q6UX06 510 aa19.15■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.15■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.15■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 IL27Q8NEV9 243 aa19.15■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 CDR1P51861 262 aa19.14■□□□□ 0.66
TTBK1-201ENST00000259750 MNS1Q8NEH6 495 aa19.14■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.14■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.14■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 TTLL5Q6EMB2 1281 aa19.13■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 CAGE1Q8TC20 777 aa19.13■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 OFD1O75665 1012 aa19.13■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 RUNDC1Q96C34 613 aa19.12■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 LNPKQ9C0E8 428 aa19.12■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.11■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 XBP1P17861 261 aa19.11■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.11■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 GNAI1P63096 354 aa19.11■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.1■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 FSD1Q9BTV5 496 aa19.09■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.09■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.08■□□□□ 0.65
TTBK1-201ENST00000259750 NUCB2P80303 420 aa19.08■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.08■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.08■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.07■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 WWC2Q6AWC2 1192 aa19.07■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 PAF1Q8N7H5 531 aa19.07■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 PANK1Q8TE04 598 aa19.07■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 MRE11P49959 708 aa19.07■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 CNTROBQ8N137 903 aa19.07■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 CALRP27797 417 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa19.06■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.06■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.06■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 PSMA5P28066 241 aa19.05■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 NASPP49321 788 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.05■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 ATP2B1P20020 1258 aa19.05■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.05■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.05■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 CABP2Q9NPB3 220 aa19.05■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 SART3Q15020 963 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 STRN4Q9NRL3 753 aa19.04■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 CDC45O75419 566 aa19.04■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 HSP90B2PQ58FF3 399 aa19.04■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 KIF21BO75037 1637 aa19.04■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 TRAK2O60296 914 aa19.03■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 SDF4Q9BRK5 362 aa19.03■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 AKNAQ7Z591 1439 aa19.03■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 SMC2O95347 1197 aa19.02■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 KRT18P05783 430 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
TTBK1-201ENST00000259750 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms