RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.39■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.39■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 CCDC27Q2M243 656 aa16.39■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.38■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.38■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 PRAM1Q96QH2 718 aa16.38■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.37■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 BICD2Q8TD16 824 aa16.37■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 HOMER1Q86YM7 354 aa16.37■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.35■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 CRBNQ96SW2 442 aa16.34■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.34■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.33■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 EPS15P42566 896 aa16.33■□□□□ 0.21
TMX4-201ENST00000246024 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.33■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.32■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.32■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 OFD1O75665 1012 aa16.32■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.31■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.31■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 WASHC4Q2M389 1173 aa16.31■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 RUFY1Q96T51 708 aa16.31■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.3■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 RNF20Q5VTR2 975 aa16.3■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 ADAMTS2O95450 1211 aa16.29■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.29■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.27■□□□□ 0.2
TMX4-201ENST00000246024 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.27■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 MTHFSP49914 203 aa16.27■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 CDR1P51861 262 aa16.27■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 REC8O95072 547 aa16.26■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.26■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 CABP1Q9NZU7 370 aa16.26■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 MYL6BP14649 208 aa16.25■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 SKIDA1Q1XH10 827 aa16.25■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 E9PSI1 815 aa16.25■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 CDK19Q9BWU1 502 aa16.25■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.25■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.25■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 AK7Q96M32 723 aa16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 BRMS1Q9HCU9 246 aa16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 PDE3BQ13370 1112 aa16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 FAM161AQ3B820 660 aa16.24■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 GRIN2BQ13224 1484 aa16.23■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.23■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 PDILTQ8N807 584 aa16.23■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.23■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.23■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa16.23■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.22■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 PANK1Q8TE04 598 aa16.22■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.22■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.22■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 ATP2B1P20020 1258 aa16.22■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 TEX35Q5T0J7 233 aa16.22■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 ATP2B2Q01814 1243 aa16.21■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 LNPKQ9C0E8 428 aa16.21■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.21■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 PRKAR2BP31323 418 aa16.21■□□□□ 0.19
TMX4-201ENST00000246024 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 CABP4P57796 275 aa16.21■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 RUNDC1Q96C34 613 aa16.21■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 CAGE1Q8TC20 777 aa16.2■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 MNS1Q8NEH6 495 aa16.2■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 XBP1P17861 261 aa16.2■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.19■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.19■□□□□ 0.18
TMX4-201ENST00000246024 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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