RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.86■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.86■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 TBX22Q9Y458 520 aa22.86■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.83■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.83■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.82■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.82■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 CABP2Q9NPB3 220 aa22.82■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.82■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 CPS1P31327 1500 aa22.81■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.81■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 TMC1Q8TDI8 760 aa22.81■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.81■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 DIP2AQ14689 1571 aa22.8■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.8■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 NLRP13Q86W25 1043 aa22.79■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.79■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 CDK19Q9BWU1 502 aa22.78■■□□□ 1.24
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.76■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.75■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 PTPRUQ92729 1446 aa22.75■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.74■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 PIK3R4Q99570 1358 aa22.74■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.72■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.72■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.71■■□□□ 1.23
TVP23C-201ENST00000225576 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.7■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 PTCH1Q13635 1447 aa22.7■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 PPP2R1AP30153 589 aa22.68■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 USP32Q8NFA0 1604 aa22.68■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.67■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 A0A1W2PP64 1363 aa22.66■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 CABP1Q9NZU7 370 aa22.65■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 ADGRB2O60241 1585 aa22.65■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 NSD2O96028 1365 aa22.65■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.64■■□□□ 1.22
TVP23C-201ENST00000225576 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 ATP7BP35670 1465 aa22.62■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.62■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 MORC1Q86VD1 984 aa22.6■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 INSRP06213 1382 aa22.59■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 KCNA6P17658 529 aa22.59■■□□□ 1.21
TVP23C-201ENST00000225576 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.58■■□□□ 1.2
TVP23C-201ENST00000225576 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TVP23C-201ENST00000225576 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.56■■□□□ 1.2
TVP23C-201ENST00000225576 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.56■■□□□ 1.2
TVP23C-201ENST00000225576 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.55■■□□□ 1.2
TVP23C-201ENST00000225576 FYB1O15117 783 aa22.53■■□□□ 1.2
TVP23C-201ENST00000225576 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TVP23C-201ENST00000225576 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.52■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.51■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.48■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.47■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.46■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.46■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
TVP23C-201ENST00000225576 HSPA2P54652 639 aa22.45■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.45■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.186e-8■■■■□ 26.3
TVP23C-201ENST00000225576 NWD1Q149M9 1564 aa22.44■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 MTHFSP49914 203 aa22.43■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 ACEP12821 1306 aa22.43■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.43■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 NUTM2FA1L443 756 aa22.42■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.42■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 AKAP12Q02952 1782 aa22.42■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 STRCQ7RTU9 1775 aa22.42■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 CFAP53Q96M91 514 aa22.41■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.4■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.4■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 FBXO41Q8TF61 875 aa22.4■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TVP23C-201ENST00000225576 ITSN1Q15811 1721 aa22.39■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 USP6P35125 1406 aa22.38■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.38■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.37■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 NME9Q86XW9 330 aa22.36■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.36■■□□□ 1.17
TVP23C-201ENST00000225576 SSH2Q76I76 1423 aa22.35■■□□□ 1.17
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