RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000195173.8

SEMA5B-201, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SEMA5B, Length 4,523 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-201ENST00000195173 HMMRO75330 724 aa18.72■□□□□ 0.59
SEMA5B-201ENST00000195173 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SEMA5B-201ENST00000195173 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SEMA5B-201ENST00000195173 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SEMA5B-201ENST00000195173 PANK2Q9BZ23 570 aa18.71■□□□□ 0.59
SEMA5B-201ENST00000195173 SYNJ2O15056 1496 aa18.7■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.7■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 PZPP20742 1482 aa18.7■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.69■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.69■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.69■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 FGD1P98174 961 aa18.68■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 CDC45O75419 566 aa18.68■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 NUCB2P80303 420 aa18.68■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.67■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 STK31Q9BXU1 1019 aa18.67■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.67■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 KDM6BO15054 1643 aa18.67■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.67■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 PRKAR2BP31323 418 aa18.66■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.66■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.66■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.65■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 REC8O95072 547 aa18.65■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.65■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 MPNDQ8N594 471 aa18.64■□□□□ 0.58
SEMA5B-201ENST00000195173 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.64■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 RLBP1P12271 317 aa18.64■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.64■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.64■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 NECTIN2Q92692 538 aa18.63■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 GNAI1P63096 354 aa18.62■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.62■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 TRIM27P14373 513 aa18.61■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.61■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.61■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.61■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.61■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.6■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 IFT140Q96RY7 1462 aa18.6■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 PHF14O94880 888 aa18.59■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.59■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.59■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 NEK4P51957 841 aa18.59■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 GCC1Q96CN9 775 aa18.58■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 COG3Q96JB2 828 aa18.58■□□□□ 0.57
SEMA5B-201ENST00000195173 SSFA2P28290 1259 aa18.57■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 RABEP1Q15276 862 aa18.56■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.56■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 TPM2P07951 284 aa18.55■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.55■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 GRIN2AQ12879 1464 aa18.54■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.53■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.53■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 WDR62O43379 1518 aa18.53■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 PRAM1Q96QH2 718 aa18.53■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.52■□□□□ 0.56
SEMA5B-201ENST00000195173 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.52■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 CABP1Q9NZU7 370 aa18.51■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.5■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 KIF14Q15058 1648 aa18.5■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 AMPHP49418 695 aa18.5■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 CLCN1P35523 988 aa18.49■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.49■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.49■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.48■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.48■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.48■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.47■□□□□ 0.55
SEMA5B-201ENST00000195173 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms