RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDX5	P30044	214 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR15	P49685	360 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	BPIFB3	P59826	476 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTR2	P61160	394 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SCARB2	Q14108	478 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RTL10	Q7L3V2	364 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR156	Q8NFN8	814 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IFI44	Q8TCB0	444 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	DESI2	Q9BSY9	194 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	WDCP	Q9H6R7	721 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GJB3	O75712	270 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTL6B	O94805	426 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MPIG6B	O95866	241 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	C1QTNF9	P0C862	333 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	THBS2	P35442	1172 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	COPA	P53621	1224 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX8	P57073	446 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NKX3-2	P78367	333 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FSTL1	Q12841	308 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC13A2	Q13183	592 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB39A	Q14964	217 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	VWA3B	Q502W6	1294 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CFHR4	Q92496	578 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP2A3	Q93084	1043 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	YME1L1	Q96TA2	773 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CHST8	Q9H2A9	424 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SRRD	Q9UH36	339 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MED16	Q9Y2X0	877 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	AFF2	P51816	1311 aa		5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		5.46	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ATRN	O75882	1429 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	RGPD5	Q99666	1765 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	PGM3	O95394	542 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP2C8	P10632	490 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	NPPB	P16860	134 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	SCP2	P22307	547 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCD3	P28288	659 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	AP2B1	P63010	937 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	RASA2	Q15283	850 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZVL8	140 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR63	Q8IWG1	891 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF125	Q96EQ8	232 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	TMX3	Q96JJ7	454 aa		5.46	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms