RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 NACA2Q9H009 215 aa18.8■□□□□ 0.6
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CTDNEP1-207ENST00000572043 HHLA1C9JL84 531 aa18.79■□□□□ 0.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYP26A1O43174 497 aa18.79■□□□□ 0.6
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CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC4A11Q8NBS3 891 aa18.79■□□□□ 0.6
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.78■□□□□ 0.6
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CTDNEP1-207ENST00000572043 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
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CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM270Q6UE05 265 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIGZQ86VD9 579 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTC30AQ86WT1 665 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM59Q8IWR1 403 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.74■□□□□ 0.59
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB44Q8NCP5 570 aa18.74■□□□□ 0.59
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