RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 CAPN15O75808 1086 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 NDUFV1P49821 464 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 CACNA2D1P54289 1103 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 DYNLT1P63172 113 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ADCY1Q08828 1119 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ABI1Q8IZP0 508 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ATL2Q8NHH9 583 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 KCNK16Q96T55 309 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TCTN1Q2MV58 587 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 CALN1Q9BXU9 219 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 WBP1LQ9NX94 342 aa21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 H3BQF6 201 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 COL6A1P12109 1028 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 PTPN9P43378 593 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TKTL1P51854 596 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 PLTPP55058 493 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 CCL23P55773 120 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 FAM193AP78312 1265 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ARCQ7LC44 396 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM209Q96SK2 561 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 HIPK3Q9H422 1215 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 LIASO43766 372 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 GAS8O95995 478 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 CDH6P55285 790 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 HDAC4P56524 1084 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TAZQ16635 292 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 FMO2Q99518 471 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 ASIC3Q9UHC3 531 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 GOLGA6BA6NDN3 693 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 CST8O60676 142 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 HSF2BPO75031 334 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 GATMP50440 423 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 FAM171BQ6P995 826 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 RFX6Q8HWS3 928 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 MREGQ8N565 214 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS1-212ENST00000568900 TYMPP19971 482 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 DEFB106AQ8N104 65 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 FBXO25Q8TCJ0 367 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 APBB2Q92870 758 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 BDNFP23560 247 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 MATKP42679 507 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 MMRN1Q13201 1228 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 PTK6Q13882 451 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM60Q495X7 471 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 BOLA3Q53S33 107 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 LRRTM3Q86VH5 581 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 TSPY1Q01534 308 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-212ENST00000568900 TLE2Q04725 743 aa21.81■■□□□ 1.08
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