RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PBX3	P40426	434 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NAMPT	P43490	491 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	OR1G1	P47890	313 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NPTX2	P47972	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RAB27A	P51159	221 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	EFNA5	P52803	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC12A3	P55017	1021 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM189B	P81408	668 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	AMPD3	Q01432	767 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KRT17	Q04695	432 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ORC1	Q13415	861 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GIT2	Q14161	759 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SEZ6	Q53EL9	994 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ARSH	Q5FYA8	562 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ATL3	Q6DD88	541 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	IQUB	Q8NA54	791 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RABGGTA	Q92696	567 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GAD1	Q99259	594 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PANK4	Q9NVE7	773 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SNTG2	Q9NY99	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KLK13	Q9UKR3	277 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	IPP	Q9Y573	584 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	VWA8	A3KMH1	1905 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MYMK	A6NI61	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ACKR2	O00590	384 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC26A4	O43511	780 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LRP3	O75074	770 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TADA2A	O75478	443 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	OFD1	O75665	1012 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GCNT3	O95395	438 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CXCL14	O95715	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MYB	P10242	640 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CASP1	P29466	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LIG4	P49917	911 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	BCAR1	P56945	870 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ASIC1	P78348	528 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	UBE3A	Q05086	875 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	POU5F1B	Q06416	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PTPN14	Q15678	1187 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	HYI	Q5T013	277 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TMC7	Q7Z402	723 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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