RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.8□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.8□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 RHOCP08134 193 aa8.8□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 PSEN2P49810 448 aa8.8□□□□□ -1
PTPRB-208ENST00000550358 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
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PTPRB-208ENST00000550358 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
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