RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542555.1

CLPB-211, Transcript of ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin, humanhuman

TSL 2

Gene CLPB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPB-211ENST00000542555 ASB3Q9Y575 518 aa8.69□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ATRXP46100 2492 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 H0Y626 953 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 PODXLO00592 558 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 EXTL3O43909 919 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CDKL5O76039 1030 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 TRIM16O95361 564 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 LYPLA2O95372 231 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 SEC24AO95486 1093 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 FAM87AP0C7U9 286 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CCR2P41597 374 aa8.68□□□□□ -1.02
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CLPB-211ENST00000542555 RARRES1P49788 294 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 EPHA5P54756 1037 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 LMAN2Q12907 356 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 VEPH1Q14D04 833 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 NTRK3Q16288 839 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 PLK5Q496M5 336 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 FBXO43Q4G163 708 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 GPR158Q5T848 1215 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 TCHPQ9BT92 498 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CEP72Q9P209 647 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 USP24Q9UPU5 2620 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 NID2Q14112 1375 aa8.68□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 K7ERI5 159 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ARNTLO00327 626 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 GIPC1O14908 333 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 APBB3O95704 486 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 DRD1P21728 446 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 DPP6P42658 865 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 MCM2P49736 904 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 DGKEP52429 567 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 BFSP1Q12934 665 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 PSMD2Q13200 908 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 NAB2Q15742 525 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CALCRLQ16602 461 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ERMNQ8TAM6 284 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 TCEAL3Q969E4 200 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ACAP3Q96P50 834 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 YIPF1Q9Y548 306 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CHD6Q8TD26 2715 aa8.67□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CPA1P15085 419 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 RPS6KB1P23443 525 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 GABRR2P28476 465 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CDC25CP30307 473 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CDK5R2Q13319 367 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 DEFB124Q8NES8 71 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 WASF1Q92558 559 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 HAS1Q92839 578 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 DRC1Q96MC2 740 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 TASP1Q9H6P5 420 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 GKN1Q9NS71 199 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.66□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 LNP1A1A4G5 178 aa8.65□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 OR6C75A6NL08 312 aa8.65□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 MOSPD3O75425 235 aa8.65□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 ALDH1A2O94788 518 aa8.65□□□□□ -1.02
CLPB-211ENST00000542555 AVPR1AP37288 418 aa8.65□□□□□ -1.02
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