RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	ADCY3	O60266	1144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	EGFR	P00533	1210 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	AKR1A1	P14550	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	CDC16	Q13042	620 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	SMAP	O00193	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	FDFT1	P37268	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	KCNK10	P57789	538 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	FNTA	P49354	379 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	HPCA	P84074	193 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	UBE3A	Q05086	875 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	PSTPIP1	O43586	416 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	RAP1GDS1	P52306	607 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	GPC2	Q8N158	579 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	KLRC2	P26717	231 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	LSP1	P33241	339 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	TRIP10	Q15642	601 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATE1-208	ENST00000540606	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	EML1	O00423	815 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	MT-CO1	P00395	513 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	GZMA	P12544	262 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	HSD17B3	P37058	310 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	FAM162A	Q96A26	154 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	FICD	Q9BVA6	458 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	NME5	P56597	212 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	MFSD10	Q14728	455 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	GAD1	Q99259	594 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CLPB	Q9H078	707 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	DSE	Q9UL01	958 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	VPS26A	O75436	327 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PCDH8	O95206	1070 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PDK2	Q15119	407 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22

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