RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SMIM22K7EJ46 135 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ATP2A1O14983 1001 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ZBED4O75132 1171 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KLHL18O94889 574 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 FAHP16930 419 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NFATC3Q12968 1075 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ITGA7Q13683 1181 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 RAB33AQ14088 237 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CDSNQ15517 529 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 PHF19Q5T6S3 580 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ARMC3Q5W041 872 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 NSMFQ6X4W1 530 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 DNERQ8NFT8 737 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 LRRC45Q96CN5 670 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ABCG4Q9H172 646 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 CERS4Q9HA82 394 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.46□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 BLACEA4D250 179 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 FIBPO43427 364 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TCEA3O75764 348 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 BCAR3O75815 825 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CABYRO75952 493 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PFKMP08237 780 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 GNAT1P11488 350 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 COL6A2P12110 1019 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PPP2CBP62714 309 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PPP2CAP67775 309 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ATP8B2P98198 1209 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ODR4Q5SWX8 454 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 C12orf60Q5U649 245 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TEX9Q8N6V9 391 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SUN5Q8TC36 379 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 BICD2Q8TD16 824 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SCLYQ96I15 445 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 UROC1Q96N76 676 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 VCX3BQ9H321 246 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TBK1Q9UHD2 729 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NLRC5Q86WI3 1866 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 LPXNO60711 386 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC6O75061 913 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NEBLO76041 1014 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 KNG1P01042 644 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CHGBP05060 677 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PDGFRBP09619 1106 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 NEK2P51955 445 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZBED6P86452 979 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ZXDAP98168 799 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TNFAIP2Q03169 654 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TAP1Q03518 808 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 CRYMQ14894 314 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SPECC1Q5M775 1068 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TMEM110Q86TL2 294 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 TLK2Q86UE8 772 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ARL10Q8N8L6 244 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 SNX27Q96L92 541 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-212ENST00000535535 KCNJ15Q99712 375 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms