RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 NRCAMQ92823 1304 aa8.2□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TREHO43280 583 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SNX16P57768 344 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TUBA1BP68363 451 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CENPCQ03188 943 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 KYAT1Q16773 422 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RGMBQ6NW40 437 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TUBA1AQ71U36 451 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PRELID2Q8N945 189 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C12orf29Q8N999 325 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PTPN18Q99952 460 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TBK1Q9UHD2 729 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 H7C0C1 242 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CAPN9O14815 690 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 B4GALT4O60513 344 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 IQCF3P0C7M6 154 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 NR1D1P20393 614 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CDC25CP30307 473 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MAN1A1P33908 653 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HSD17B3P37058 310 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5OP48047 213 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PSEN2P49810 448 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CAMK2BQ13554 666 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C14orf80Q86SX3 495 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC43Q8N309 656 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TFAP2BQ92481 460 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RUBCNQ92622 972 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GDF3Q9NR23 364 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CHST7Q9NS84 486 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 HEY1Q9Y5J3 304 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PCNTO95613 3336 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K6O95382 1288 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 LCP1P13796 627 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CDC42EP1Q00587 391 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF410Q86VK4 478 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 LMNTD2Q8IXW0 634 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MGARPQ8TDB4 240 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.19□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 E7EVH7 732 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TSPAN1O60635 241 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 MMP8P22894 467 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SDC4P31431 198 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CDH6P55285 790 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R40P59535 323 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 BASP1P80723 227 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GRB14Q14449 540 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CHADLQ6NUI6 762 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf74Q86VG3 221 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 SH3GL2Q99962 352 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 O00370 1275 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 CST8O60676 142 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 KRT7P08729 469 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPS1-208ENST00000519076 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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