RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515484.2

GPBP1-209, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

TSL 2

Gene GPBP1, Length 962 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-209	ENST00000515484	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	TSPAN6	O43657	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	THBS4	P35443	961 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	PRKAG1	P54619	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	LMAN2	Q12907	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	CNGA2	Q16280	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-209	ENST00000515484	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484		H7C4K7	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	TPP1	O14773	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	EXOC3	O60645	756 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ZBED1	O96006	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	MYF5	P13349	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	DIO1	P49895	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	GBX1	Q14549	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	MLC1	Q15049	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	APIP	Q96GX9	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484		H3BNC9	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	FCHO1	O14526	889 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	USP1	O94782	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	BRAF	P15056	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	EPHA3	P29320	983 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	MCM5	P33992	734 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	FHL3	Q13643	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	GRM3	Q14832	879 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SEC23B	Q15437	767 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	INSC	Q1MX18	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	MT-CO3	P00414	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	HGF	P14210	728 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ITGB6	P18564	788 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484		Q4G0T1	1027 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	PPEF2	O14830	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	KCNAB3	O43448	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	A1BG	P04217	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ACVR2A	P27037	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	PTGER1	P34995	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CACNB3	P54284	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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