RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SASH3	O75995	380 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PLS3	P13797	630 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ATF6	P18850	670 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	GJA4	P35212	333 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF9	P41273	254 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNAR2	P48551	515 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGK	Q92643	395 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DSE	Q9UL01	958 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PATE3	B3GLJ2	98 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YCG3	227 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PPEF2	O14830	753 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX3	P23760	479 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK8	P45983	427 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP12	P59046	1061 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRA4	P59901	499 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RING1	Q06587	406 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	LMAN2	Q12907	356 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK7	Q13164	816 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PDIA5	Q14554	519 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MTF1	Q14872	753 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R082	166 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB561D2	O14569	222 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH1A2	O94788	518 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CKM	P06732	381 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCY2C	P25092	1073 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	IRX4	P78413	519 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA1	Q5VX52	437 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	JADE1	Q6IE81	842 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	GATA6	Q92908	595 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SPACA7	Q96KW9	195 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	OGT	O15294	1046 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CSH1	P0DML2	217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CSH2	P0DML3	217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC25A	P30304	524 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF6	P49848	677 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ANAPC15	P60006	121 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPY1	Q01534	308 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54

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