RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF276Q8N554 614 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 IL17REQ8NFR9 667 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 THAP4Q8WY91 577 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 PDP2Q9P2J9 529 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 NFU1Q9UMS0 254 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 COL15A1P39059 1388 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD11A6QL63 1104 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 SRGNP10124 158 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRC-212ENST00000491302 ADD2P35612 726 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 NXPH1P58417 271 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 CSHL1Q14406 222 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 GLOD4Q9HC38 313 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ADM5C9JUS6 153 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 K7ESM1 405 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PPM1DO15297 605 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 NTSR1P30989 418 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 DDIT3P35638 169 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TIRAPP58753 221 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SYNE4Q8N205 404 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 KLC2Q9H0B6 622 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PNMA2Q9UL42 364 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GVC2 190 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD9O00233 223 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 AGR2O95994 175 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PYGLP06737 847 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PPP3CBP16298 524 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 AKT1P31749 480 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PNLIPRP1P54315 467 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 JAG1P78504 1218 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM17P78536 824 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 GUCY1B3Q02153 619 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PLP2Q04941 152 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 NFIXQ14938 502 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM60Q495X7 471 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 WDR24Q96S15 920 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TTPALQ9BTX7 342 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ZAR1LA6NP61 321 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 HOXA5P20719 270 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 GRM4Q14833 912 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 NAXEQ8NCW5 288 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM2Q99965 735 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 CEP72Q9P209 647 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 DKK2Q9UBU2 259 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 AGPSO00116 658 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PEX11BO96011 259 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 KLRK1P26718 216 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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