RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ASB3	Q9Y575	518 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SI	P14410	1827 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620		A8MXQ7	604 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620		H7C0C1	242 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SMAP	O00193	183 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	WNT10B	O00744	389 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CYB561D2	O14569	222 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RNF8	O76064	485 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT19	P08727	400 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ARL2	P36404	184 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ATP5O	P48047	213 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	POLE2	P56282	527 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	BMPR2	Q13873	1038 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CAPS	Q13938	189 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	FAXC	Q5TGI0	409 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	THTPA	Q9BU02	230 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT82	Q9NSB4	513 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	POLI	Q9UNA4	740 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT37	O76014	449 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TSHR	P16473	764 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	AQP5	P55064	265 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RILP	Q96NA2	401 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TTC1	Q99614	292 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	USP18	Q9UMW8	372 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PIK3R2	O00459	728 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PLSCR1	O15162	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CIB2	O75838	187 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	BAG2	O95816	211 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ERBB2	P04626	1255 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ASPA	P45381	313 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	AP3M2	P53677	418 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CDH6	P55285	790 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CDH8	P55286	799 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	BIRC2	Q13490	618 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNJ11	Q14654	390 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MGAM	O43451	1857 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CAPN14	A8MX76	684 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KLF11	O14901	512 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNN4	O15554	427 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ADCY3	O60266	1144 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	UGT1A9	O60656	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SPAG6	O75602	509 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	AP1G2	O75843	785 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TAZ	Q16635	292 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CDO1	Q16878	200 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RAB6C	Q53S08	254 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ATG16L1	Q676U5	607 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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