RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 ZMIZ2Q8NF64 920 aa24.21■■□□□ 1.47
C9orf3-216ENST00000478603 TAF4BQ92750 862 aa24.21■■□□□ 1.47
C9orf3-216ENST00000478603 SMOQ99835 787 aa24.21■■□□□ 1.47
C9orf3-216ENST00000478603 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.21■■□□□ 1.47
C9orf3-216ENST00000478603 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.21■■□□□ 1.47
C9orf3-216ENST00000478603 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
C9orf3-216ENST00000478603 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ANTXRLA6NF34 631 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 COCHO43405 550 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CYP17A1P05093 508 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 GCLMP48507 274 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 PPP3CAQ08209 521 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 NFIL3Q16649 462 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 C12orf29Q8N999 325 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 GMIPQ9P107 970 aa24.2■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 MAPK13O15264 365 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 GAB3Q8WWW8 586 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 TWNKQ96RR1 684 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CCSER2Q9H7U1 834 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SEMA4GQ9NTN9 838 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 IL37Q9NZH6 218 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 RPP40O75818 363 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ADORA2BP29275 332 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 PGFP49763 221 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SEC13P55735 322 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 MAP3K7CLP57077 242 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ARHGAP8P85298 464 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 DMC1Q14565 340 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 DHCR24Q15392 516 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 HECTD3Q5T447 861 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SYT13Q7L8C5 426 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 UNC93AQ86WB7 457 aa24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 K7EQS6 105 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CCDC192P0DO97 292 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 KRT13P13646 458 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SLC6A11P48066 632 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ADAM9Q13443 819 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 KBTBD6Q86V97 674 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 AXIN1O15169 862 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 LRP3O75074 770 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 MESP2Q0VG99 397 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 C2orf27AQ580R0 203 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 C12orf40Q86WS4 652 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SFTPA1Q8IWL2 248 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 KIAA1958Q8N8K9 716 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 USP33Q8TEY7 942 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 ACDQ96AP0 544 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 COMMD8Q9NX08 183 aa24.16■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 FAM92AA1XBS5 289 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CD58P19256 250 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 INCA1Q0VD86 236 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 PNOCQ13519 176 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CSRP2Q16527 193 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 PRR23CQ6ZRP0 262 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 WBP2Q969T9 261 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 SPTBN2O15020 2390 aa24.14■■□□□ 1.46
C9orf3-216ENST00000478603 E2F8A0AVK6 867 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 APBB3O95704 486 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 FAM200BP0CF97 657 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 IRF1P10914 325 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 SDHBP21912 280 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 TUBP50607 506 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 CCDC6Q16204 474 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 WHAMMQ8TF30 809 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 NIF3L1Q9GZT8 377 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa24.14■■□□□ 1.45
C9orf3-216ENST00000478603 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms