RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 HOXA6P31267 233 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 MAP3K7CLP57077 242 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 PPP3CAQ08209 521 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 NFIL3Q16649 462 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 HECTD3Q5T447 861 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 UNC93AQ86WB7 457 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 HHIPQ96QV1 700 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 NACA2Q9H009 215 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 PARD6AQ9NPB6 346 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 GMIPQ9P107 970 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 MYO16Q9Y6X6 1858 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-204ENST00000468807 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa23.08■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SDK1Q7Z5N4 2213 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 TNFRSF10BO14763 440 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 COCHO43405 550 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CYP17A1P05093 508 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 RETP07949 1114 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CCDC192P0DO97 292 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CD58P19256 250 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SEC13P55735 322 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 LMNB2Q03252 620 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 PNOCQ13519 176 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SMOQ99835 787 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CACNA1AO00555 2505 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 BEST1O76090 585 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 FAM200BP0CF97 657 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 MYOFQ9NZM1 2061 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 RPP40O75818 363 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 OPRD1P41143 372 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 DHCR24Q15392 516 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 C2orf27AQ580R0 203 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 GAB3Q8WWW8 586 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ACDQ96AP0 544 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 TWNKQ96RR1 684 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 RMND1Q9NWS8 449 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 COMMD8Q9NX08 183 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SPAG17Q6Q759 2223 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 IRF1P10914 325 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 TGM1P22735 817 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ARHGAP8P85298 464 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 INCA1Q0VD86 236 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 DMC1Q14565 340 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SYT13Q7L8C5 426 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CAMKK1Q8N5S9 505 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 DLL3Q9NYJ7 618 aa23.04■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CETN3O15182 167 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ADH1CP00326 375 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SDHBP21912 280 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 MXI1P50539 228 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 KRT39Q6A163 491 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 KIAA1958Q8N8K9 716 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SEMA4GQ9NTN9 838 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 IL37Q9NZH6 218 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 TBC1D14Q9P2M4 693 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 EML5Q05BV3 1969 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 E2F8A0AVK6 867 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 AXIN1O15169 862 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 APBB3O95704 486 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ADH5P11766 374 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 SLC6A11P48066 632 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 TUBP50607 506 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 NUCB2P80303 420 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ENPEPQ07075 957 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 GAB4Q2WGN9 574 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-204ENST00000468807 ZNF394Q53GI3 561 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms