RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	KCNMA1	Q12791	1236 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	NCAPH	Q15003	741 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PIGZ	Q86VD9	579 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	PRRX2	Q99811	253 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SIX2	Q9NPC8	291 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	OBP2A	Q9NY56	170 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	IL37	Q9NZH6	218 aa		18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	KRBA1	A5PL33	1030 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CYP26A1	O43174	497 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	THAP12	O43422	761 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	KIF11	P52732	1056 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ZNF132	P52740	706 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	NHLH1	Q02575	133 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	STIL	Q15468	1287 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CNGA2	Q16280	664 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	HECTD3	Q5T447	861 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	RNF38	Q9H0F5	515 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	SCML2	Q9UQR0	700 aa		18.71	■□□□□ 0.59
USP19-210	ENST00000465902	TULP2	O00295	520 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CHAD	O15335	359 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SETSIP	P0DME0	302 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PFKL	P17858	780 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	GNA15	P30679	374 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TKTL1	P51854	596 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PRSS33	Q8NF86	280 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SHD	Q96IW2	340 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	NAGPA	Q9UK23	515 aa		18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	FAM92A	A1XBS5	289 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	MED7	O43513	233 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ATP1A3	P13637	1013 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ZNF18	P17022	549 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	RGS7	P49802	495 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	NUBP1	P53384	320 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	UBXN1	Q04323	297 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TTC8	Q8TAM2	541 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SHC3	Q92529	594 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	DNASE1L2	Q92874	299 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ACP6	Q9NPH0	428 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	GKN1	Q9NS71	199 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CPQ	Q9Y646	472 aa		18.69	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	F5	P12259	2224 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQH9	124 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	LGALS16	A8MUM7	142 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PIK3R2	O00459	728 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	COCH	O43405	550 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TLR5	O60602	858 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	LCP1	P13796	627 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PGF	P49763	221 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	KLK7	P49862	253 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TPM4	P67936	248 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PLCB2	Q00722	1185 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PTK2	Q05397	1052 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ADIG	Q0VDE8	80 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	MTF1	Q14872	753 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	NFKBIB	Q15653	356 aa		18.68	■□□□□ 0.58

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