RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MTRRQ9UBK8 725 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 HHLA1C9JL84 531 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PIK3R2O00459 728 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TBC1D4O60343 1298 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 GABBR2O75899 941 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 BEST1O76090 585 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZBED1O96006 694 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SOD2P04179 222 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ACRP10323 421 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CPB1P15086 417 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 NOS2P35228 1153 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 FLT3P36888 993 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 DAOAP59103 153 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TAS2R40P59535 323 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CREMQ03060 361 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CCDC142Q17RM4 750 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PM20D1Q6GTS8 502 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 VSIG1Q86XK7 387 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 LRRN4CLQ8ND94 238 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TEKT4Q8WW24 435 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CHST7Q9NS84 486 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 HOMER3Q9NSC5 361 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 COMMD8Q9NX08 183 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SPG21Q9NZD8 308 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 INSL6Q9Y581 213 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PTPRSQ13332 1948 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZBBXA8MT70 800 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MDM4O15151 490 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PRPSAP2O60256 369 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 GJB5O95377 273 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 KRT1P04264 644 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PYGMP11217 842 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 GRIK1P39086 918 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 C2orf54Q08AI8 447 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ELF2Q15723 593 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLC25A52Q3SY17 297 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CCDC14Q49A88 953 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 BOLA3Q53S33 107 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RTP2Q5QGT7 225 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 SLC8B1Q6J4K2 584 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 C8orf74Q6P047 294 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZNF365Q70YC5 407 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CPNE8Q86YQ8 564 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CCDC50Q8IVM0 306 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ARHGAP18Q8N392 663 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 HERVK_113Q902F9 699 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 BADQ92934 168 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 FAM149B1Q96BN6 582 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 TMEM209Q96SK2 561 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 KCNK16Q96T55 309 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 HCSTQ9UBK5 93 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 MAFFQ9ULX9 164 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 USP18Q9UMW8 372 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 USP3Q9Y6I4 520 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 ZNF487B1APH4 448 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa13.47□□□□□ -0.25
NISCH-203ENST00000460759 CAPN9O14815 690 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms