RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 CISHQ9NSE2 258 aa25.07■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 MYOFQ9NZM1 2061 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 LEFTY2O00292 366 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 ZNF394Q53GI3 561 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 TTC39CQ8N584 583 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 PAK1Q13153 545 aa25.05■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 SLC4A11Q8NBS3 891 aa25.05■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.05■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 FMO5P49326 533 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 STX17P56962 302 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.04■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 Q6ZS52 159 aa25.04■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 ATP2A3Q93084 1043 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 ECT2Q9H8V3 914 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 COCHO43405 550 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 PGFP49763 221 aa25.03■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 HECTD3Q5T447 861 aa25.03■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 TSSK4Q6SA08 328 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.03■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 PMM2O15305 246 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 GJA4P35212 333 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-202ENST00000460160 TUBP50607 506 aa25.02■■□□□ 1.6
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HOXB3-202ENST00000460160 AMPD2Q01433 879 aa25.01■■□□□ 1.59
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HOXB3-202ENST00000460160 ZSCAN32Q9NX65 697 aa25■■□□□ 1.59
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HOXB3-202ENST00000460160 KIF11P52732 1056 aa24.99■■□□□ 1.59
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HOXB3-202ENST00000460160 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB44Q8NCP5 570 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 TLR5O60602 858 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 GNA14O95837 355 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 CXCL12P48061 93 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 LMO3Q8TAP4 145 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 P2RY13Q9BPV8 354 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-202ENST00000460160 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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