RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	KXD1	Q9BQD3	176 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	STK33	Q9BYT3	514 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CBX8	Q9HC52	389 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CYLD	Q9NQC7	956 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CHAD	O15335	359 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ATP1A3	P13637	1013 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	HDC	P19113	662 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SLC7A9	P82251	487 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	UBXN1	Q04323	297 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PDE4C	Q08493	712 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	HECTD3	Q5T447	861 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GJB7	Q6PEY0	223 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ASIC4	Q96FT7	647 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GAN	Q9H2C0	597 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf78	A6NCI8	922 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PRR33	A8MZF0	331 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241		M0QYV0	167 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF12	O95522	483 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CKM	P06732	381 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GLUL	P15104	373 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	VIPR2	P41587	438 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	APBA1	Q02410	837 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SYCP1	Q15431	976 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	YAF2	Q8IY57	180 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MSANTD3	Q96H12	275 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GMIP	Q9P107	970 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	F5	P12259	2224 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	COL4A2	P08572	1712 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GTH6	734 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PQC6	194 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM221	A6NGB7	291 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241		F8VZ95	297 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241		M0R296	226 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	THAP12	O43422	761 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO21	O94952	628 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	CLCN1	P35523	988 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	USP8	P40818	1118 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GPD2	P43304	727 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ACADSB	P45954	432 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	GPC5	P78333	572 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	USP4	Q13107	963 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LUZP1	Q86V48	1076 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	NEK11	Q8NG66	645 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	SHD	Q96IW2	340 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LHX5	Q9H2C1	402 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	BRD9	Q9H8M2	597 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	MYO6	Q9UM54	1294 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TRIO	O75962	3097 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF263	O14978	683 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CYP26A1	O43174	497 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TLR5	O60602	858 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZBED1	O96006	694 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RALA	P11233	206 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TKTL1	P51854	596 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	JAM2	P57087	298 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SNX16	P57768	344 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PTPA-222	ENST00000445241	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05

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