RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 SLC7A9P82251 487 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 HECTD3Q5T447 861 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 Q6ZS52 159 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 TTC39CQ8N584 583 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM176AQ96HP8 235 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO44Q9H4M3 255 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CCSER2Q9H7U1 834 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 COMMD8Q9NX08 183 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CFAP97Q9P2B7 532 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 COQ4Q9Y3A0 265 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 PRR23AA6NEV1 266 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 ACO1P21399 889 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 AMPD2Q01433 879 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CUL2Q13617 745 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 EML3Q32P44 896 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 SLC4A11Q8NBS3 891 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 FAXDC2Q96IV6 333 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 IL37Q9NZH6 218 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 DMDP11532 3685 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 COCHO43405 550 aa29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 RAD23BP54727 409 aa29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 DGKKQ5KSL6 1271 aa29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CREBRFQ8IUR6 639 aa29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 TRIML1Q8N9V2 468 aa29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 MYO16Q9Y6X6 1858 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CYP26A1O43174 497 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 OLFM2O95897 454 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 TCF3P15923 654 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 GJA4P35212 333 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 NR1H3Q13133 447 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 GAS6Q14393 721 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CHFRQ96EP1 664 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 NFATC1O95644 943 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 PGFP49763 221 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CCR3P51677 355 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 SATB1Q01826 763 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CETN1Q12798 172 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 PPP2R5DQ14738 602 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF528Q3MIS6 628 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 IER2Q9BTL4 223 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 DUSP16Q9BY84 665 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 HHLA1C9JL84 531 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 GNA14O95837 355 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 IRF1P10914 325 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CXCL12P48061 93 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 CCINQ13939 588 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 FSTL4Q6MZW2 842 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 ATRIPQ8WXE1 791 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 NT5C1BQ96P26 610 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 P2RY13Q9BPV8 354 aa29.27■■■□□ 2.28
FAAP20-210ENST00000440825 FAM92AA1XBS5 289 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TLR5O60602 858 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 CD19P15391 556 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 GALK1P51570 392 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM196Q5HYL7 178 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 SNX30Q5VWJ9 437 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 FOXR2Q6PJQ5 311 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 PPM1KQ8N3J5 372 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 SPEM1Q8N4L4 309 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 SCML2Q9UQR0 700 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 EGFP01133 1207 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 KCNH2Q12809 1159 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 EXOC4Q96A65 974 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 CLSTN2Q9H4D0 955 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 PNPLA8Q9NP80 782 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 ZSCAN32Q9NX65 697 aa29.25■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1W2PQH9 124 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TBX18O95935 607 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 LMNAP02545 664 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC192P0DO97 292 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TUBP50607 506 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 SLC8A3P57103 927 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 SGO2Q562F6 1265 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM59Q8IWR1 403 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 CD101Q93033 1021 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 RWDD2AQ9UIY3 292 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa29.24■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 AFPP02771 609 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGAP17Q68EM7 881 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 SYNPOQ8N3V7 929 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms