RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 TPM2P07951 284 aa19.01■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 PLCB2Q00722 1185 aa19.01■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 BST2Q10589 180 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 CNGA2Q16280 664 aa19.01■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 ZSWIM1Q9BR11 485 aa19.01■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 USP8P40818 1118 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 PGFP49763 221 aa19■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 USP4Q13107 963 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 MTF1Q14872 753 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 STILQ15468 1287 aa19■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa19■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 NMUR1Q9HB89 426 aa19■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 SMPD4Q9NXE4 827 aa19■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 KANSL1LA0AUZ9 987 aa18.98■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 ZNF18P17022 549 aa18.98■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 PLA2G4AP47712 749 aa18.98■□□□□ 0.63
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HERC3-205ENST00000426683 ACP6Q9NPH0 428 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 OSER1Q9NX31 292 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 NAGPAQ9UK23 515 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 COL4A3Q01955 1670 aa18.98■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 PATJQ8NI35 1801 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 SMTNL1A8MU46 457 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 THAP12O43422 761 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 RARGP13631 454 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 GNA15P30679 374 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 SOX9P48436 509 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 IFNAR2P48551 515 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ZNF165P49910 485 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.97■□□□□ 0.63
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