RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
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PTPRZ1-201ENST00000393386 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 LOC100653049A0A140TA62 436 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 HAT1O14929 419 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
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PTPRZ1-201ENST00000393386 PTPN21Q16825 1174 aa5.71□□□□□ -1.5
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PTPRZ1-201ENST00000393386 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
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PTPRZ1-201ENST00000393386 ARHGDIBP52566 201 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 C1orf189Q5VU69 101 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRZ1-201ENST00000393386 PCSK1NQ9UHG2 260 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A1W2PQC6 194 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 PIK3CDO00329 1044 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDGFRBP09619 1106 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 ETS2P15036 469 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 VAV1P15498 845 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 ITGA3P26006 1051 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCND2P30279 289 aa5.7□□□□□ -1.5
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