RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 J3KRW8 73 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MEN1O00255 615 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G6O60733 806 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPA4LO95757 839 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TFEBP19484 476 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 CHMP4BP1P59074 171 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 TTI2Q6NXR4 508 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 CNSTQ6PJW8 725 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NELFBQ8WX92 580 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 CAPN9O14815 690 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TJP3O95049 919 aa7.09□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCG1P45844 678 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GNG11P61952 73 aa7.09□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.09□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 K7EPI3 171 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 STAT2P52630 851 aa7.09□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXJ1Q92949 421 aa7.09□□□□□ -1.27
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