RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 POLE2P56282 527 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 AP2B1P63010 937 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 VGLL4Q14135 290 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RCN1Q15293 331 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NCSTNQ92542 709 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 KRT35Q92764 455 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GATA6Q92908 595 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GJA10Q969M2 543 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PMEPA1Q969W9 287 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NUP85Q9BW27 656 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ANO3Q9BYT9 981 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GPR88Q9GZN0 384 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PARP14Q460N5 1801 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CAPN9O14815 690 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PSTPIP1O43586 416 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EDIL3O43854 480 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEC1O60732 1142 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GH1P01241 217 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ICAM1P05362 532 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EPHB2P29323 1055 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEA4P43358 317 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CASP4P49662 377 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 OAZ1P54368 228 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DSG1Q02413 1049 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CDK18Q07002 472 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ENPEPQ07075 957 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC3Q13217 504 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.26e-28■□□□□ 8.9
CTPS1-201ENST00000372616 MORF4L2Q15014 288 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TMED2Q15363 201 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RASIP1Q5U651 963 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CENPUQ71F23 418 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF677Q86XU0 584 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MYCT1Q8N699 235 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF653Q96CK0 615 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZWILCHQ9H900 591 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.52□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRFP10586 1907 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 NFASCO94856 1347 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 CLIC2O15247 247 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 GSC2O15499 205 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP6O75344 327 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 T-ENOLP0DO92 83 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 IMPDH2P12268 514 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 IVDP26440 423 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 CDC25CP30307 473 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 FOXN2P32314 431 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 CIITAP33076 1130 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 RAP1GDS1P52306 607 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB16Q05516 673 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 PPIL2Q13356 520 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 ITGA9Q13797 1035 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 PRKG1Q13976 671 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 MPP2Q14168 576 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 COG2Q14746 738 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 GJB7Q6PEY0 223 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.52□□□□□ -1.21
CTPS1-201ENST00000372616 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.52□□□□□ -1.21
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