RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 UBA3Q8TBC4 463 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 STK32AQ8WU08 396 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CLUHO75153 1309 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 FGFR1P11362 822 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 GDF10P55107 478 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 BBS12Q6ZW61 710 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 DPH6Q7L8W6 267 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 LONP2Q86WA8 852 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKMY2Q8IV38 441 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO41Q8TF61 875 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 COL1A2P08123 1366 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIP11Q15643 1979 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BRB1 525 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 MIPP30301 263 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 WASHC2DQ5SRD0 308 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRP9Q7RTR0 991 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 DHRS4Q9BTZ2 278 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SPON1Q9HCB6 807 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SAR1AQ9NR31 198 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ZFP69BQ9UJL9 534 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PDHXO00330 501 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 HMGCRP04035 888 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 VDRP11473 427 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 NDST1P52848 882 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL4CP56559 192 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNA1P78396 465 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 INCA1Q0VD86 236 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TAF11Q15544 211 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ADGRD1Q6QNK2 874 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PYROXD1Q8WU10 500 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 DPP3Q9NY33 737 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CBX6O95503 412 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 P4HA1P13674 534 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL38Q2WGJ6 581 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ACAP3Q96P50 834 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TLE6Q9H808 572 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 C2CD2Q9Y426 696 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PIK3R2O00459 728 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TM9SF1O15321 606 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 BANF1O75531 89 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPN4P29074 926 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ACSS3Q9H6R3 686 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 NPHS2Q9NP85 383 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC42Q9Y546 428 aa24.92■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TPBGLP0DKB5 382 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 GM2AP17900 193 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 EPHB2P29323 1055 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIK4Q16099 956 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 KYAT1Q16773 422 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB6CQ53S08 254 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TRNP1Q6NT89 227 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CPT1BQ92523 772 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PEBP4Q96S96 227 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PAFAH2Q99487 392 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 USP18Q9UMW8 372 aa24.91■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ADRA1DP25100 572 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 RBP5P82980 135 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 GAD2Q05329 585 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 BLMHQ13867 455 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CLNKQ7Z7G1 428 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.9■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC13Q8NBP0 860 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms