RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 CHI3L2Q15782 390 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 GALNTL6Q49A17 601 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 MICALL2Q8IY33 904 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PGBD4Q96DM1 585 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 FBXL18Q96ME1 805 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 GMLQ99445 158 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TIPINQ9BVW5 301 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 EBF2Q9HAK2 575 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.26□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 USP12O75317 370 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 LRCH4O75427 683 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CAPSQ13938 189 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TRIM11Q96F44 468 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 FAM81BQ96LP2 452 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 EBF4Q9BQW3 602 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PSTPIP1O43586 416 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 DCTN3O75935 186 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PDGFRBP09619 1106 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TPBGLP0DKB5 382 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PDGFRAP16234 1089 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CALB2P22676 271 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PGM1P36871 562 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 AQP5P55064 265 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CRYMQ14894 314 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PDK4Q16654 411 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CCNJLQ8IV13 435 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 STK32AQ8WU08 396 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 HACL1Q9UJ83 578 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CCDC160A6NGH7 325 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PMM2O15305 246 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 DGKIO75912 1065 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 KCNA2P16389 499 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 GARTP22102 1010 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 MMP8P22894 467 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 RBL1P28749 1068 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 PHBP35232 272 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CDKN2BP42772 138 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 NEK3P51956 506 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SLC25A3Q00325 362 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TRIM74Q86UV6 250 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TRIM73Q86UV7 250 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 BBOF1Q8ND07 529 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 C10orf82Q8WW14 230 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 LPAR1Q92633 364 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SLCO2A1Q92959 643 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SYT15Q9BQS2 421 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 HES2Q9Y543 173 aa9.25□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 NEMP1O14524 444 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 FCHO1O14526 889 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TBC1D12O60347 775 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 ERBB2P04626 1255 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 NFICP08651 508 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 SOX11P35716 441 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 STAT5BP51692 787 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 CAV1Q03135 178 aa9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
THBS3-201ENST00000368378 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms