RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNX14Q9Y5W7 946 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL15A1P39059 1388 aa2.84□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZAR1LA6NP61 321 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TAF5LO75529 589 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCR1O76036 304 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RECQL4O94761 1208 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RHOBTB3O94955 611 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 LMNAP02545 664 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TK1P04183 234 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITGB3P05106 788 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRKCBP05771 671 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLBP06746 335 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 GATA3P23771 443 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACRV1P26436 265 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNTFP26441 200 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRKAR1BP31321 381 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 AKT1P31749 480 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDK7P50613 346 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACTR2P61160 394 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 CUL4BQ13620 913 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLCA4Q14CN2 919 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 BTBD16Q32M84 506 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 BEAN1Q3B7T3 259 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 HS1BP3Q53T59 392 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RABL3Q5HYI8 236 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TTC22Q5TAA0 569 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RINT1Q6NUQ1 792 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARMC6Q6NXE6 501 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 NFRKBQ6P4R8 1299 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCGF5Q86SE9 256 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIAH1Q8IUQ4 282 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ESX1Q8N693 406 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR6Y1Q8NGX8 325 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC30A5Q8TAD4 765 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SKA1Q96BD8 255 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM136AQ96C01 138 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF31Q96EP0 1072 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TEPSINQ96N21 525 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 VN1R3Q9BXE9 311 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 VPS16Q9H269 839 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 GALNT9Q9HCQ5 603 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RIC8AQ9NPQ8 531 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 AKIP1Q9NQ31 210 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 G6PC2Q9NQR9 355 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RASSF1Q9NS23 344 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 INTS13Q9NVM9 706 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TERF2IPQ9NYB0 399 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNTN6Q9UQ52 1028 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADAMTS20P59510 1910 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 GXYLT2A0PJZ3 443 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNX2O60749 519 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP6R2O75170 966 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPP40O75818 363 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDKL5O76039 1030 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM163BP0C2L3 166 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TNFAIP3P21580 790 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 LIFRP42702 1097 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 GATMP50440 423 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCR5P51681 352 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TIRAPP58753 221 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADAM17P78536 824 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 MPP1Q00013 466 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SP2Q02086 613 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TLE2Q04725 743 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 MTAPQ13126 283 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RESTQ13127 1097 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACOX1Q15067 660 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 LY6KQ17RY6 165 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEPDC1Q5TB30 811 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD45Q5TZF3 282 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RETSATQ6NUM9 610 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSANTD2Q6P1R3 559 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 RRAGAQ7L523 313 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRABD2AQ86V40 505 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms