RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 COCHO43405 550 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 VDRP11473 427 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ARSAP15289 507 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 BRD2P25440 801 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 KIF11P52732 1056 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF132P52740 706 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SLC7A9P82251 487 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 KCNJ12Q14500 433 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 STX1AQ16623 288 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 GBP6Q6ZN66 633 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NMUR1Q9HB89 426 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 GKN1Q9NS71 199 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 OSER1Q9NX31 292 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SMPD4Q9NXE4 827 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SCML2Q9UQR0 700 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CPQQ9Y646 472 aa15.76■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 LEFTY2O00292 366 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PAEPP09466 180 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TCF3P15923 654 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PFKLP17858 780 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PON1P27169 355 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PDE6CP51160 858 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 BCAT1P54687 386 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PLCB2Q00722 1185 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PDE4CQ08493 712 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TCF15Q12870 199 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 VWA3BQ502W6 1294 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PIGZQ86VD9 579 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 UBA3Q8TBC4 463 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NDST4Q9H3R1 872 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 EBF3Q9H4W6 596 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SIX2Q9NPC8 291 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ANO10Q9NW15 660 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 USP3Q9Y6I4 520 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 F5P12259 2224 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PQH9 124 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 FAM170BA6NMN3 283 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TYRO3Q06418 890 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PKDCCQ504Y2 493 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 RAB41Q5JT25 222 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 HECTD3Q5T447 861 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SCD5Q86SK9 330 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 WBP2Q969T9 261 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CHFRQ96EP1 664 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 BECN2A8MW95 431 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TLR5O60602 858 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TBX18O95935 607 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 KRT5P13647 590 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CTHP32929 405 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TUBP50607 506 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 KCNMA1Q12791 1236 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 FZD5Q13467 585 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 RUNX3Q13761 415 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 EML3Q32P44 896 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 LCLAT1Q6UWP7 414 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 FAM3CQ92520 227 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms