RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 COCHO43405 550 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PAEPP09466 180 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PDE4CQ08493 712 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 MTF1Q14872 753 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 HPS4Q9NQG7 708 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 GKN1Q9NS71 199 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 CPQQ9Y646 472 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PIAS3Q9Y6X2 628 aa28.48■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 RFX1P22670 979 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SLC7A9P82251 487 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SNX30Q5VWJ9 437 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 FAM83CQ9BQN1 747 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO44Q9H4M3 255 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ACP6Q9NPH0 428 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 APEX2Q9UBZ4 518 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 CNTN6Q9UQ52 1028 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SCML2Q9UQR0 700 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa28.47■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 KMT2EQ8IZD2 1858 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 DENND4CQ5VZ89 1909 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 KANSL1LA0AUZ9 987 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 BECN2A8MW95 431 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 DCNP07585 359 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 KRT5P13647 590 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 GLULP15104 373 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ARSAP15289 507 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 TARSP26639 723 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 KCNMA1Q12791 1236 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 NCAPHQ15003 741 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PKDCCQ504Y2 493 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PRSS33Q8NF86 280 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PJA1Q8NG27 643 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SHDQ96IW2 340 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 LTB4R2Q9NPC1 389 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 WNT6Q9Y6F9 365 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 USP3Q9Y6I4 520 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PATJQ8NI35 1801 aa28.46■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa28.45■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PQH9 124 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 LEFTY2O00292 366 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 PFKLP17858 780 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 BCAT1P54687 386 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 UBXN2BQ14CS0 331 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 KRT31Q15323 416 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP44Q17R89 818 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 LCLAT1Q6UWP7 414 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 SCD5Q86SK9 330 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC105Q8IYK2 499 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 HSD3B7Q9H2F3 369 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 EBF3Q9H4W6 596 aa28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF318Q5VUA4 2279 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 PES1O00541 588 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TCF3P15923 654 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 PDE6CP51160 858 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 MYL5Q02045 173 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 BST2Q10589 180 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 RAB41Q5JT25 222 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 HECTD3Q5T447 861 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TXNDC11Q6PKC3 985 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 HESX1Q9UBX0 185 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1257Q9ULG3 409 aa28.44■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 GABBR2O75899 941 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TBX18O95935 607 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 MFAP3P55082 362 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 PLCB2Q00722 1185 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ANO6Q4KMQ2 910 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC186Q7Z3E2 898 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF687Q8N1G0 1237 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 WBP2Q969T9 261 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CHFRQ96EP1 664 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 UBXN6Q9BZV1 441 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 VPS16Q9H269 839 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 NUDT5Q9UKK9 219 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 SIT1Q9Y3P8 196 aa28.43■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 FAM170BA6NMN3 283 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 M0QYV0 167 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TLR5O60602 858 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TUBP50607 506 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TKTL1P51854 596 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL40Q2TBA0 621 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 AOPEPQ8N6M6 819 aa28.42■■■□□ 2.14
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