RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRO3102Q9H379 93 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO44Q9H4M3 255 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa28.81■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 TGM5O43548 720 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 PALMO75781 387 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GJB6O95452 261 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC24AO95486 1093 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLUD1P00367 558 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP17L7P0C7H9 530 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRS1P35568 1242 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 MESDQ14696 234 aa28.8■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC4CQ8WTT0 213 aa28.8■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa28.8■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DESP17661 470 aa28.79■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC26A9Q7LBE3 791 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCAMP5Q8TAC9 235 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRGQQ8WZA9 623 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 EHD2Q9NZN4 543 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 IP6K2Q9UHH9 426 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRID2IPA4D2P6 1211 aa28.79■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GRAP2O75791 330 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNNT1P13805 278 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 DAOAP59103 153 aa28.79■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF12Q16514 161 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC149Q6ZUS6 474 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCML4Q8N228 414 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35F6Q8N357 371 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR152Q8TDT2 470 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIPC2Q8TF65 315 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTBD6Q96KE9 485 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 COMMD8Q9NX08 183 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 YIPF1Q9Y548 306 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP3Q9Y6I4 520 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSF2BPO75031 334 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLI1P08151 1106 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA31D3P0C874 917 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDPD5Q8WTR4 605 aa28.78■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf63Q6NUN7 778 aa28.77■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM62Q9BVG3 475 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM7Q9C029 511 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAI1Q9UI46 699 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM59LQ9UK28 342 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 INSL5Q9Y5Q6 135 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PPC1 479 aa28.76■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ATF6P18850 670 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 YWHAQP27348 245 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHB3P54753 998 aa28.76■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1RP00736 705 aa28.75■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CSH2P0DML3 217 aa28.75■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARCQ7LC44 396 aa28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 STKLD1Q8NE28 680 aa28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNIP1Q8TF40 1166 aa28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 POPDC2Q9HBU9 364 aa28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCML2Q9UQR0 700 aa28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.75■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 YJEFN3A6XGL0 299 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 E7ENQ6 273 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAPN9O14815 690 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 PROSCO94903 275 aa28.74■■■□□ 2.19
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