RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251968.3

TSG101-201, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSG101, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-201ENST00000251968 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.17■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 VSTM1Q6UX27 236 aa20.17■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.17■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.17■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.17■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.17■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.17■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.17■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 FBXO21O94952 628 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 URODP06132 367 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 DAOAP59103 153 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CCDC14Q49A88 953 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 STKLD1Q8NE28 680 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 PBKQ96KB5 322 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CEP104O60308 925 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 LRCH4O75427 683 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SOAT2O75908 522 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 ZBED1O96006 694 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 GJC1P36383 396 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 MAGEA11P43364 429 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SLC5A3P53794 718 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SMARCB1Q12824 385 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 DUSP4Q13115 394 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CDO1Q16878 200 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CNPY3Q9BT09 278 aa20.16■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 E7ENQ6 273 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 TNFRSF10BO14763 440 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 TRIM66O15016 1216 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 HSF2BPO75031 334 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 MYOGP15173 224 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SDC4P31431 198 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 ATP11AP98196 1134 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SHHQ15465 462 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 RAB6CQ53S08 254 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CCDC181Q5TID7 509 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 ARCQ7LC44 396 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 C8orf48Q96LL4 319 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CARD9Q9H257 536 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 USP3Q9Y6I4 520 aa20.15■□□□□ 0.82
TSG101-201ENST00000251968 CES2O00748 559 aa20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 RWDD2BP57060 319 aa20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 AADACL2Q6P093 401 aa20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 DEFB106AQ8N104 65 aa20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 MNS1Q8NEH6 495 aa20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 GPR152Q8TDT2 470 aa20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 PLXNA3P51805 1871 aa20.14■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 LINC01553A4QN01 128 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 DPYSL4O14531 572 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 PSTPIP1O43586 416 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 RNF8O76064 485 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 CTNNB1P35222 781 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 BMPR1AP36894 532 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 ACAP1Q15027 740 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 CEP112Q8N8E3 955 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 ZBP1Q9H171 429 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 DAB1O75553 588 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 PYGMP11217 842 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 MATKP42679 507 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 DCAF6Q58WW2 860 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 SPRED2Q7Z698 418 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.13■□□□□ 0.81
TSG101-201ENST00000251968 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms