RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189048.6

Tardbp-223, Transcript of TAR DNA-binding protein 43, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Tardbp, Length 1,096 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Chrna4	O70174	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	App	P12023	770 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Atoh1	P48985	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Polg	P54099	1218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cacnb3	P54285	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Krt2	Q3TTY5	707 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dvl3	Q61062	716 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mc2r	Q64326	296 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Egfl8	Q6GUQ1	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Krt40	Q6IFX3	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Retreg2	Q6NS82	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Krit1	Q6S5J6	736 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ppip5k2	Q6ZQB6	1129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Otop1	Q80VM9	600 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	U2af1l4	Q8BGJ9	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hlf	Q8BW74	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sowahb	Q8BZW2	760 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Klk15	Q8CGR4	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sde2	Q8K1J5	448 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pank3	Q8R2W9	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Wasf3	Q8VHI6	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcgf6	Q99NA9	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aldh1b1	Q9CZS1	519 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Abcb6	Q9DC29	842 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cntn6	Q9JMB8	1028 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sae1	Q9R1T2	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Vnn1	Q9Z0K8	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Col12a1	Q60847	3120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nlrc5	C3VPR6	1915 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	4931408C20Rik	E9PWP9	1381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cpd	O89001	1377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Znf541	Q0GGX2	1363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Map3k15	A2AQW0	1331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm7168	A0AUV4	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pkd2l1	A2A259	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Exoc6b	A6H5Z3	810 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	4930435E12Rik	A6X8Z9	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cpb1	B2RS76	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm281	D3Z1Y0	860 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm20683	H3BKJ1	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gtpbp1	O08582	668 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Shoc2	O88520	582 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Il1a	P01582	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Igh-1a	P01865	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Catspere	P0DP43	985 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cyp2b10	P12791	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cd86	P42082	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kcna2	P63141	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Bend4	P86174	541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tigd2	Q0VBL1	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mlxip	Q2VPU4	917 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Wdr36	Q3TAQ9	899 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ube2fb	Q3UWQ3	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nr1h2	Q60644	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Krt74	Q6IFZ9	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcdh8	Q7TSK3	1070 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nrip1	Q8CBD1	1161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mbtps2	Q8CHX6	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rhot2	Q8JZN7	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Il31ra	Q8K5B1	716 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Oaf	Q8QZR4	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ackr4	Q924I3	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Susd3	Q9D176	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	P33monox	Q9DBN4	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ndst3	Q9EQH7	873 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Popdc2	Q9ES82	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Eefsec	Q9JHW4	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Panx1	Q9JIP4	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nudt5	Q9JKX6	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sh2d2a	Q9QXK9	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Syt5	Q9R0N5	386 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Myh13	B1AR69	1938 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Heg1	E9Q7X6	1337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sik3	Q6P4S6	1311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Znfx1	Q8R151	1909 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Igkv4-54	A0A0G2JES9	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Btg4	O70552	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Defa-rs2	P17534	91 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ptgir	P43252	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Vps4b	P46467	444 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mmp14	P53690	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Btbd1	P58544	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slc8a1	P70414	970 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nat8l	Q3UGX3	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rnf10	Q3UIW5	804 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lrcol1	Q3URS3	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ptpn18	Q61152	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Znf532	Q6NXK2	1036 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ntrk3	Q6VNS1	825 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lrrc24	Q8BHA1	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Elovl5	Q8BHI7	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cstf2	Q8BIQ5	580 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	E330021D16Rik	Q8BW45	371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	IntS13	Q8QZV7	732 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Vmn1r17	Q8R2D8	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Usp15	Q8R5H1	981 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gckr	Q91X44	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Bicd2	Q921C5	820 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sf3b3	Q921M3	1217 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lamtor5	Q9D1L9	91 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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