RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036229.12

Ctdp1-201, Transcript of RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdp1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nlrc4Q3UP24 1024 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kat14Q8CID0 779 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ginm1Q91WR6 327 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Crtc3Q91X84 619 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rnf167Q91XF4 347 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc5a2Q923I7 670 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Med10Q9CXU0 135 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 PrameQ9D4Z5 464 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 H2-OaQ9QWV1 250 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Asap1Q9QWY8 1147 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dnajb7Q9QYI8 312 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slfn14V9GXG1 899 aa15.17■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Aox3G3X982 1335 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MttpO08601 894 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 DldO08749 509 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 StrnO55106 780 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf112Q0VAW7 879 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mief2Q5NCS9 454 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mef2aQ60929 498 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Btnl1Q7TST0 509 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 ItpkaQ8R071 459 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fundc1Q9DB70 155 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Alpk3Q924C5 1678 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Myh15E9Q264 1925 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm3752A6NAT4 150 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pole2O54956 527 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Aff2O55112 1272 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Hk1P17710 974 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 AmhP27106 555 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Foxk1P42128 719 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 CiitaP79621 1155 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zscan26Q5RJ54 466 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mgat5Q8R4G6 740 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lrrc18Q9CQ07 262 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Hnrnpa0Q9CX86 305 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lrrc63A6H694 637 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cdk2ap1O35207 114 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 AoahO35298 574 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ncam1P13595 1115 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 PcnaP17918 261 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc24a2Q14BI1 711 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Prkaa1Q5EG47 559 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ankrd13bQ5F259 626 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Q8BGC1 442 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trim60Q8VI40 466 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trim39Q9ESN2 488 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Aqp5Q9WTY4 265 aa15.16■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Adgra3Q7TT36 1310 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc16a2O70324 545 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nr1h2Q60644 446 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ankrd23Q812A3 306 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Arhgap28Q8BN58 729 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 ClmnQ8C5W0 1052 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 ItchQ8C863 864 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Agap3Q8VHH5 910 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fam227bQ9D518 532 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 1700018B08RikQ9DA83 213 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr703Q9EPF5 319 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cib1Q9Z0F4 191 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr615Q8VGY4 313 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gstt4Q9D4P7 240 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gid8Q9D7M1 228 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cst12Q9DAN8 128 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Capn10Q9ESK3 666 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 C1qbP14106 253 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Epb41l4aP52963 686 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 GalcP54818 684 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ptchd3Q0EEE2 906 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 YdjcQ14BV6 310 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Samd11Q1RNF8 542 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rmdn3Q3UJU9 470 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Prm3Q62100 101 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Six1Q62231 284 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 P2ry10Q8BFU7 328 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Qsox1Q8BND5 748 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Acat1Q8QZT1 424 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slc18a1Q8R090 521 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rmnd5bQ91YQ7 393 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pdia5Q921X9 517 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rnf31Q924T7 1066 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Homer2Q9QWW1 354 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Eya4Q9Z191 616 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Arid3bQ9Z1N7 568 aa15.15■□□□□ 0.02
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Grem2O88273 168 aa15.14■□□□□ 0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 DdcO88533 480 aa15.14■□□□□ 0.01
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Plk1Q07832 603 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.2 ms