RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B SHG1P38337 142 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SRB7P47822 140 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B EFM5P53200 248 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B VPS9P54787 451 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YHR050W-AQ05451 56 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YLR365WQ7LIF2 110 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YKL075CP36083 450 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YBR032WP38223 100 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B FMP23P38231 175 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YGL041C-BQ3E750 60 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YHR214C-DP0CX93 97 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B MAG1P22134 296 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B FPR2P32472 135 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B ATP19P81451 68 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B GIM5Q04493 163 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B RRT15Q3E811 62 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B XPT1P47165 209 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B ATP14Q12349 124 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YOR376W-AQ3E805 51 aa-1.06□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YLR053CQ12026 108 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B ECM12O13529 151 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B ROX3P25046 220 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B TCA17P32613 152 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YKL044WP36092 106 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B IRC18P47056 224 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YPL261CQ08976 102 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B HFA1P32874 2273 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SKI3P17883 1432 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YFR009W-AP0C5M9 85 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SEC59P20048 519 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YCR050CP25630 102 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SKI6P46948 246 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YPL067CQ02754 198 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B MSS2P40990 351 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B GNA1P43577 159 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SGF11Q03067 99 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B NCB2Q92317 146 aa-1.07□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B MCM22P47167 239 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B TVP18Q04767 167 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B NAT5Q08689 176 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YDR381C-AQ3E6R5 114 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B HMRA2P0CY13 119 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YHL042WP38729 150 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YHR173CP38864 112 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B PAU12P53343 120 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YKL018C-AQ3E7A7 99 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B PAU24P38155 120 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YNL140CP53910 189 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B GPI19Q04082 140 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YPD1Q07688 167 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YKL065W-AQ2V2P2 73 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YKL068W-AQ3E826 78 aa-1.08□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B HSP12P22943 109 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B PAU2P32612 120 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B TOM22P49334 152 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B ERV25P54837 211 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B HPT1Q04178 221 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SMT3Q12306 101 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B APS3P47064 194 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B ATP17Q06405 101 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B TAO3P40468 2376 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B RPL14AP36105 138 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SNN1P48232 102 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B TIM8P57744 87 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YMR103CQ04436 120 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B CMC2Q3E7A4 109 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SCS22Q6Q595 175 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B ENV10Q99382 181 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B CNB1P25296 175 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B UBC12P52491 188 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B ATG10Q07879 167 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B YNR034W-AQ3E841 98 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B TOR1P35169 2470 aa-1.09□□□□□ -2.58
YHL009W-BYHL009W-B SWM2P40342 146 aa-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B PAC10P48363 199 aa-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B RPC10P40422 70 aa-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B ATP7P30902 174 aa-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B TOM6P33448 61 aa-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B RPL38P49167 78 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B YPL038W-AQ3E7B4 63 aa-1.1□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B RDI1Q12434 202 aa-1.12□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B YBL071CP38185 102 aa-1.12□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B YOR381W-AQ3E804 55 aa-1.12□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B YER181CP40097 107 aa-1.12□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B LDB18Q07887 179 aa-1.12□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B MRP17P28778 131 aa-1.13□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B ARL3Q02804 198 aa-1.13□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B SMD2Q06217 110 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B FRQ1Q06389 190 aa-1.13□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B INO4P13902 151 aa-1.13□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B NSL1Q12143 216 aa-1.13□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B TIM11P81449 96 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
YHL009W-BYHL009W-B YLR363W-AQ3E747 85 aa-1.13□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.2 ms